בזרימת Pickup in store של שופיפיי, הזמנה עוברת סדר מוגדר של סטטוסים: הלקוח מזמין אונליין, הצוות מכין את הפריטים ומסמן Ready for pickup (מוכן לאיסוף) — Shopify שולחת אוטומטית אימייל ו-SMS ללקוח — ולאחר שהלקוח מגיע ומקבל את ההזמנה, הצוות מסמן Picked up. רק בשלב הזה ההזמנה נחשבת מסופקת (fulfilled) וניתן לסגור אותה.
בחנויות ישראליות עם מספר סניפים חשוב לוודא שכל Location מוגדר כ-"Fulfills online orders" ב-Shopify Admin, שהמלאי מפוצל נכון בין הסניפים, ושאימיילי האיסוף יוצאים בעברית. אם משתמשים ב-POS (מכירה בחנות הפיזית) יחד עם איסוף אונליין באותו סניף, הסימון Picked up נעשה דרך אפליקציית ה-POS — לא דרך Admin הרגיל.