ל-Shopify ניתן לחבר מספר דומיינים לאותה חנות, אבל רק אחד מוגדר כ-Primary domain. כל ביקור בדומיין משני מחולק אוטומטית ל-redirect של 301 לדומיין הראשי — מה שמאחד את סמכות ה-SEO למקום אחד ומונע תוכן כפול. ההגדרה נמצאת תחת Online Store → Domains באדמין, ומשנים אותה בלחיצה בלבד.

בחנות ישראלית הדילמה הנפוצה היא בין `.co.il` (אמון מקומי, SEO ישראלי) ל-`.com` (נראות בינלאומית). כדאי לקנות את שניהם ולהגדיר את הדומיין המועדף כ-Primary. אם בכוונתכם להפעיל שוק נפרד לקהל בחו"ל, תוכלו לחבר דומיין שני ייעודי ולשייך אותו ל-Market (שוק) אחר — במקרה כזה הוא לא יופיע כ-Primary אלא כדומיין שוק נפרד.