כאשר קונים דומיין דרך ממשק האדמין של Shopify, הוא נרשם אוטומטית עם חידוש שנתי. Shopify שולחת התראות לאימייל של בעל החנות לפני תום התקופה, והחיוב נעשה על אותו כרטיס אשראי שמחובר לחשבון. אם החיוב נכשל — למשל כרטיס פג תוקף — הדומיין נכנס לתקופת חסד קצרה ולאחריה עלול להשתחרר ולמכירה פומבית.
בחנויות ישראליות כדאי לשים לב שדומיין `.co.il` לא ניתן לרכישה דרך Shopify עצמה — הוא מנוהל דרך ספק חיצוני כמו GoDaddy או names.co.il ומחובר לחנות ב-DNS. לכן חידוש `.co.il` לא יופיע ב-Shopify Admin אלא אצל הרשם. רק דומיינים כמו `.com`, `.store`, `.shop` שנרכשו ישירות ב-Shopify הם "דומיינים מנוהלי שופיפיי" לצורך ערך זה.