Shipping Scripts הם חלק ממשפחת Shopify Scripts — קוד Ruby קטן שרץ על שרתי Shopify בתוך ה-Checkout לפני שהלקוח רואה את אפשרויות המשלוח. דרכם אפשר, למשל, להסתיר משלוח אקספרס ללקוחות שמחוץ למרכז, להציג שם מותאם לאזור גיאוגרפי, או לתת משלוח חינם אוטומטי לחברי מועדון. הם זמינים בתוכנית Shopify Plus בלבד.
מגבלה קריטית שחשוב להכיר: Shipping Scripts לא יכולים לגשת לפיצול משלוחים (split shipping) בקופה — כלומר אי אפשר להפריד הזמנה לכמה חבילות ולחשב מחיר לכל אחת דרך הסקריפט. לצורך לוגיקה מורכבת יותר מומלץ לשקול Checkout Functions, שהן הדור הבא של Shopify Scripts ועובדות גם מחוץ ל-Plus, ומאפשרות שליטה עמוקה יותר על תהליך הקופה.