Shopify POS (Point of Sale) היא אפליקציה נפרדת שמחוברת לאותו חשבון שופיפיי כמו החנות המקוונת. הכניסה נעשית עם פרטי המשתמש הרגילים של ה-Admin, או עם PIN מקוצר שמוגדר לכל איש צוות בנפרד. ניתן להגדיר כמה עובדים עם הרשאות שונות — למשל קופאי שיכול לעבד מכירות אך לא לבצע החזרים ללא אישור מנהל.
בישראל, Shopify POS נפוץ בעסקים שמשלבים מכירה אונליין ואופליין — חנויות בוטיק, דוכני שוק, תערוכות ואירועי פופ-אפ. חשוב לוודא שמלאי מסונכרן בין הערוצים ושמוגדר מטבע ש"ח. חשוב לבדוק גם אילו ספקי סליקה (כמו טרנזילה) נתמכים ב-POS בישראל לפני שבוחרים מסופון.