ב-Shopify POS כל מכשיר (iPad, מסוף ייעודי או סמארטפון) חייב להיות משויך לחנות ספציפית ולמיקום (Location) בתוכה. המיקום קובע מאיזה מאגר מלאי מתבצעת מכירה, לאיזו קופה נכנסים התשלומים, ואיזה דוחות מסכמים את הפעילות של אותו סניף. הגדרת המיקום נעשית בשלב הכניסה למכשיר ויכולה להשתנות רק על ידי משתמש עם תפקיד POS device setup role.
בחנויות ישראליות עם כמה סניפים — למשל רשת בוטיק עם חנויות בתל אביב, ירושלים וחיפה — הגדרת ה-Location הנכונה קריטית למניעת בלבול מלאי בין סניפים ולדיוק הנהלת החשבונות. חשוב לוודא שכל קופאי/ת מחובר/ת למיקום הנכון בתחילת כל משמרת, ושהמלאי של כל מיקום מוגדר בנפרד ב-Shopify Admin.