ב-Shopify קיים הבדל מהותי בין Store owner לבין Staff member (עובד) ואפילו Admin: ה-Store owner הוא החשבון היחיד שיכול לאשר שינויי חיוב, לסגור את החנות, להעביר בעלות, ולנהל אמצעי תשלום של המנוי עצמו. ה-Staff accounts יכולים לקבל הרשאות נרחבות מאוד, אך אפילו Admin מלא לא מקבל גישה לפעולות הבעלות הבסיסיות האלה.
בתהליכים טכניים כמו שכפול חנות, העברת תבנית בין חנויות, או חיבור אפליקציות רגישות — שופיפיי ממליצה לבצע את הפעולות ספציפית כ-Store owner ולא כ-Staff, כדי למנוע שגיאות הרשאה באמצע התהליך. בחנויות ישראליות שמנוהלות על ידי צוות, כדאי לוודא שפרטי ה-Store owner מוגנים בכתובת מייל עסקית ייעודית ולא תלויים בעובד ספציפי שעלול לעזוב.