כשמסמנים הזמנה כ-Fulfilled ב-Shopify, ניתן לצרף tracking number ו-tracking URL של חברת השליחויות. מנתונים אלה Shopify מייצרת אוטומטית את עמוד המעקב הנשלח ללקוח באימייל אישור המשלוח. כשמשתמשים בחברת שליחויות ידועה (FedEx, DHL, ישראל פוסט), Shopify מזהה אותה ויוצרת את הלינק הנכון אוטומטית — אחרת צריך להזין את ה-URL ידנית.
בחנויות ישראליות שעובדות עם חברות שליחויות מקומיות (דואר ישראל, שליח עד הבית, USP, iPost) חשוב לוודא שה-tracking URL המלא מוזן ידנית, מכיוון ש-Shopify לא תמיד מזהה אותן אוטומטית. כמו כן, ניתן לשלב אפליקציות מעקב צד שלישי כמו Aftership או Tracktor שמרכזות את כל חברות השליחויות ומציגות ממשק מעקב מותאם אישית עם לוגו החנות.