ללקוח: בעמוד Checkout יש שדה 'Discount code' שבו מקלידים את הקוד (`SAVE20`). Shopify בודק שהקוד תקף, שהוא חל על הסל הנוכחי, וחל על תאריך ועליו. אם תקף, ההנחה מתווספת מיד. לסוחר: בעת יצירת draft order ניתן להוסיף הנחה ידנית באחוז או בסכום על המוצרים או על ההזמנה.
בחנות ישראלית עם הנחות מורכבות (קופון על מוצרים מסוימים בלבד, הנחה לסוגים מסוימים של לקוחות) Shopify Discounts המובנה לרוב מספיק. למקרים יוצאי דופן (משלוח חינם מותנה במשקל, הנחה לפי כמות) משתמשים ב-Shopify Functions או באפליקציה ייעודית.