ב-Shopify POS כל מוצר ווריאנט יכול לקבל ברקוד ייחודי — בין אם הספק כבר הדפיס אחד (EAN, UPC) ובין אם מייצרים ברקוד פנימי. מדפסת ברקודים מאפשרת להפיק תוויות ישירות מתוך ממשק האדמין של שופיפיי (Products → Print labels) לפי SKU, וריאנט, מחיר ושם מוצר. מדפסות תרמיות כמו Dymo LabelWriter ו-Zebra הן הנפוצות ביותר בחנויות POS.
בחנות ישראלית עם קטלוג רחב — בגדים בגדלים ובצבעים, מוצרי מזון עם תאריכי תפוגה, או ציוד טכני עם מספרי סידורי — מדפסת ברקודים חוסכת טעויות ספירת מלאי ומאיצה את קליטת הסחורה. כדאי לוודא שהמדפסת שנרכשת תואמת לדרייבר הנתמך של Shopify POS ולבדוק שגודל התווית מותאם לתצוגת המדף בחנות.