Shopify Payments עוקבת אחרי יחס ה-chargebacks של החנות ומחלקת אותו לשלוש רמות: Good standing (מצב תקין) כשהיחס מתחת ל-0.4%, At risk (בסיכון) בין 0.4% ל-0.6%, ו-Elevated risk מעל 0.6%. הגעה ל-Elevated risk אינה רק אינדיקציה — היא יכולה להוביל לעיכוב בהעברות כספים, לדרישת מילואים (reserve) מצד שופיפיי, ובמקרים קיצוניים להשעיית Shopify Payments.
בחנות ישראלית הגעה ל-Elevated risk מחייבת בדיקה של שתי סיבות עיקריות: עסקאות מרמה (כרטיסי אשראי גנובים שלא סוננו על ידי Fraud Control), ואי-שביעות רצון של לקוחות שמעדיפים לפתוח סכסוך בחברת האשראי במקום לפנות לחנות. הפתרון הוא שילוב של חמשת הנושאים: חיזוק כללי הגנת הונאה, שיפור מדיניות החזרות, הפעלת אישורי הזמנה ברורים, ומעקב שבועי אחר דוח ה-Fraud Control.