תחת קטגוריה זו ב-App Store של שופיפיי תמצאו אפליקציות לאוטומציה של תהליכי פיקינג ואריזה, הדפסת תוויות שילוח, ניהול החזרות, מעקב הזמנות בזמן אמת, וסנכרון עם חברות לוגיסטיקה ו-3PL. כל אפליקציה בקטגוריה מתממשקת לנתוני ההזמנות של החנות דרך ה-Admin API ומקבלת עדכונים על שינויי סטטוס דרך Webhooks.
בחנות ישראלית הקטגוריה הזו היא הנפוצה ביותר לשימוש — רוב הסוחרים מחברים כאן אפליקציה לחברת שליחויות ישראלית (פדקס, DHL, שליח עד הבית, קנגורו) או למערכת ניהול הזמנות (OMS). כדאי לבדוק לפני התקנה אם האפליקציה תומכת בכתובות ישראליות (ללא ZIP code חובה), בעברית בתוויות, ובמשקלים ומידות שמתאימים לתעריפי הספקים המקומיים.