ב-Shopify (שופיפיי) הארגון הוא שכבת הניהול העליונה שמאגדת מספר חנויות תחת גג אחד — רלוונטי בעיקר לחנויות Shopify Plus שמפעילות מספר storefront-ים (למשל חנות ישראלית + חנות בינלאומית + חנות B2B). שם הארגון מוצג בדאשבורד המרכזי ומשמש גם לזיהוי פנימי בחשבוניות וב-billing של Shopify.
מכיוון שרק ה-Organization owner — ולא Staff members רגילים ולא Store owners של חנויות בודדות בתוך הארגון — יכול לשנות את שם הארגון, חשוב להגדיר מראש מי מחזיק בתפקיד זה בעסק. שינוי שם ארגון לא משפיע על שמות החנויות הבודדות, ה-URL-ים שלהן, או הגדרות המס — אלה מנוהלים ברמת החנות.