תשלומים חוזרים ב-Shopify מתאפשרים דרך אפליקציות מנוי (כמו Recharge, Seal Subscriptions, Stay.ai) שמשתמשות ב-Billing API של שופיפיי או ב-Shopify Payments כדי לחייב את כרטיס הלקוח אוטומטית בכל מחזור. ב-Checkout מוצגים תנאי המנוי בצורה גלויה — תדירות המשלוח, מועד החיוב הראשון, וסימון ברור שמדובר ברכישה חוזרת — ולקוח חייב להסכים לכך באופן מפורש.
בישראל תשלומים חוזרים מציבים אתגר כפול: מצד רגולציה, חוק הגנת הצרכן מחייב שקיפות ומנגנון ביטול נוח ונגיש; מצד טכנולוגיה, לא כל ספקי הסליקה המקומיים תומכים ב-tokenization לחיוב עתידי. לפני שמשיקים מנוי בחנות ישראלית, חשוב לוודא שאפליקציית המנוי הנבחרת תואמת את ספק הסליקה ושעמוד ניהול המנוי ללקוח מוצג בעברית ומאפשר ביטול בקלות.