Stripe היא חברת תשלומים שמספקת את השכבה הטכנית שמאחורי Shopify Payments — כלומר כשסוחר מפעיל Shopify Payments, הכסף עובר בפועל דרך תשתית Stripe. בנוסף, ניתן לחבר Stripe ישירות כ-payment provider עצמאי דרך הגדרות ה-Payments של האדמין, אם Shopify Payments אינו זמין באזור המסוים או שהסוחר מעדיף אותו מסיבות עסקיות.
בהקשר של Shopify POS בישראל, Stripe רלוונטי בעיקר ברמת הרשת: מסופי POS ותהליכי תשלום דורשים גישה לדומיינים ולפורטים ספציפיים של Stripe שחייבים להיות פתוחים בחומת האש. אם רשת החנות הפיזית חוסמת תעבורה אל שרתי Stripe — עסקאות יכשלו בשקט, ולכן בעת הגדרת רשת ל-POS חובה להוסיף את דומיינים של Stripe לרשימת ההיתרים.